自2014年成立以来，香港中文大学（深圳）的学科建设已逐步完善，现有经管学院、理工学院、人文社科学院、数据科学学院、医学院、音乐学院六个学院以及一个研究生院。
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近年来，大学研究生入学人数快速增长，从2015年的79名增长到目前在校生人数3064名，尤其近两年来每年净增长超过1000名。此外，研究生项目从2015年的3个，增长到2023年初的36个——其中包含19个授课型硕士研究生项目与17个研究型硕博项目。
授课型硕士研究生项目
学院 | 项目名称 | 初运行时间 |
数据科学学院 | 金融工程理学硕士 | 2015 |
理工学院 | 通信工程理学硕士 | 2021 |
人文社科学院 | 翻译专业（笔译/口译）文学硕士 | 2015 |
同声传译文学硕士 | 2015 | |
应用心理学理学硕士 | 2018 | |
全球研究文学硕士 | 2019 | |
公共政策文学硕士 | 2022 | |
城市学社会科学硕士 | 2022 | |
中国语言文学文学硕士 | 待审批 | |
经管学院 | 金融学理学硕士 | 2016 |
经济学理学硕士 | 2017 | |
会计学理学硕士 | 2017 | |
管理学理学硕士 | 2019 | |
市场学理学硕士 | 2020 | |
金融学EMBA | 2021 | |
信息管理与商业分析 理学硕士 | 2021 | |
理工学院 与经管学院 | 供应链与物流管理高级管理人员理学硕士 | 2017 |
理工学院与数据科学学院 | 人工智能与机器人 理学硕士 | 待审批 |
数据科学学院与经管学院 | 数据科学理学硕士 | 2017 |
医学院 | 生物信息学理学硕士 | 2021 |
音乐学院 | 音乐表演文学硕士 | 2022 |
作曲与作曲技术理论 文学硕士 | 待审批 |
研究型硕博项目
学院 | 项目名称 | 初运行时间 |
经管学院 | 金融学硕士-博士衔接课程 | 2019 |
经济学硕士-博士衔接课程 | 2019 | |
会计学哲学硕士-博士衔接课程 | 预2023 | |
市场学哲学硕士-博士衔接课程 | 预2023 | |
信息管理与商业分析哲学硕士-博士衔接课程 | 预2023 | |
理工学院 | 计算机与信息工程硕士博士衔接课程 | 2016 |
材料科学与工程硕士博士衔接课程 | 2019 | |
数学硕士博士衔接课程 | 2021 | |
能源科学与工程哲学硕士-博士衔接课程 | 2022 | |
物理学哲学硕士-博士衔接课程 | 预2023 | |
医学院 | 生物科学硕士-博士衔接课程 | 2018 |
生物医学工程哲学硕士-博士衔接课程 | 预2023 | |
数据科学学院 | 数据科学硕士博士衔接课程 | 2019 |
计算机科学哲学硕士-博士衔接课程 | 2022 | |
人文社科学院 | 全球研究硕士博士衔接课程 | 2021 |
应用心理学哲学硕士-博士衔接课程 | 2022 | |
翻译哲学硕士-博士衔接课程 | 2022 |
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